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产前超声异常胎儿的全基因组拷贝数变异分析
Analysis of genome-wide copy number variations among fetuses with abnormalities detected by prenatal uitrasouography
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]温州医科大学检验医学院、生命科学学院,浙江325035 [2]浙江省温州市中心医院中心实验室,325000
基 金:卫生部科研基金(WKJ2011-2-017);浙江省自然科学基金(LY13H200002)
年 份:2017
卷 号:34
期 号:2
起止页码:178-182
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2014、CAS、CSCD、CSCD2017_2018、EMBASE、IC、JST、PUBMED、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:目的采用单核苷酸多态性微阵列芯片(single nucleotide polymorphism array,SNParray)技术对超声提示异常的胎儿进行全基因组拷贝数变异(copynumbervariations,CNVs)检测,并探讨超声异常胎儿与CNVs的相关性及遗传学病因。方法收集208例超声提示异常的胎儿标本,同时进行SNParray检测及染色体核型分析,比较两种方法的检测能力。对于复杂疑难的CNVs,用荧光原位杂交技术、荧光定量PCR、多重连接探针扩增等技术进行验证确认。结果在208例超声异常的标本中,异常染色体核型检出率为8.2%(17/208),SNParray的检出率为13.9%(29/208)。在超声提示心血管异常、多发畸形、脑部异常的标本中,致病性CNVs分别占4.6%(8/174)、2.3%(4/174)、1.1%(2/174);而在超声提示肾脏异常、消化系统、骨骼系统、面部畸形及呼吸系统异常的标本中未发现致病性CNVs。结论SNP array技术是检测CNVs的较好平台。与染色体核型相比,对于胎儿超声异常的检出率明显提高。SNP array技术结合传统核型分析技术,可为超声异常胎儿的遗传咨询、疾病再发风险评估及产前诊断提供更多的线索。
关 键 词:超声异常 SNP芯片 拷贝数变异 遗传咨询
分 类 号:R440] R714.5[临床医学类]
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