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期刊文章详细信息

流感疫苗应答过程中抗体谱发育的生物信息学分析    

Bioinformatic analysis of antibody repertoire development in response to influenza vaccination

  

文献类型:期刊文章

作  者:张璐[1] 张清晨[1] 裘天颐[1] 曹志伟[1] 唐凯临[1]

Zhang Lu Zhang Qingchen Qiu Tianyi Cao Zhiwei Tang Kailin(Department of Bioinformatics, School of Life Sciences and Technology, Tongji University, ShangHai 200092, Chin)

机构地区:[1]上海同济大学生命科学与技术学院生物信息学系,200092

出  处:《中华微生物学和免疫学杂志》

年  份:2017

卷  号:37

期  号:2

起止页码:133-139

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2014、BIOSISPREVIEWS、CAS、CSCD、CSCD2017_2018、EMBASE、IC、JST、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘  要:目的 分析流感疫苗应答过程中抗体谱的发育成熟特征,为后续抗体研发提供理论依据.方法 基于三价灭活流感疫苗(trivalent influenza vaccine,TIV)刺激后的时序性抗体重链测序数据,从抗体突变程度、互补决定区3(complementary-determining region 3,CDR3)氨基酸特征、VDJ基因使用方面分析疫苗应答过程中抗体谱的发育成熟特征.结果 疫苗刺激后抗体的突变频率显著提高.CDR3的特征分析显示,带电荷氨基酸和芳香族氨基酸的使用频率较高;原始B细胞(naive B cell)中CDR3长度服从正态分布,而疫苗刺激后,15~18个氨基酸长度的CDR3序列形成主导地位.另外,免疫前后VDJ基因的使用发生明显变化,带有抗体重链胚系基因IGHV3-7的抗体序列对疫苗具有显著应答;免疫后第7天应答最为强烈,随着时间的增加应答强度逐渐减弱.结论 疫苗刺激下,抗体谱动态进化以产生特异性应答的抗体,从序列层面分析应答特征有助于衡量免疫应答的有效性.

关 键 词:疫苗 抗体谱 B细胞 CDR3 免疫应答 Complementarity-determining  region  3  (CDR3)  

分 类 号:R392] Q811.4[基础医学类]

参考文献:

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耦合文献:

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同被引文献:

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