文献类型：期刊文章

作　　者：纪耀勇[1] 韩楷钊[1] 李丹[1] 吕慧琴[1] 张晨晖[1] 刘天磊[1]

机构地区：[1]江苏大学食品与生物工程学院生物技术系,中国江苏镇江212013

出　　处：《生命科学研究》

基　　金：江苏大学高级人才科研启动基金项目(10JDG040);江苏大学大学生创新创业训练计划项目(江苏大学2016-133);江苏省大学生创新创业训练计划项目(201410299026Z)

年　　份：2017

卷　　号：21

期　　号：1

起止页码：1-5

语　　种：中文

收录情况：AJ、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD_E2017_2018、JST、WOS、ZGKJHX、ZR、普通刊

摘　　要：在拟南芥图位克隆中SSLP(simple sequence length polymorphism)是首选分子标记,当无可用SSLP时才会考虑CAPS(cleaved amplified polymorphic sequence)、d CAPS(designed CAPS)及SNAP(single nucleotide amplified polymorphism)等标记。图位克隆的第1步就是染色体着陆,需逐个检测覆盖全基因组的标记,工作繁琐,更加依赖操作相对简单的SSLP标记。但是,SSLP标记在染色体上分布不均,有些标记缺乏物理位置记录,而且很多标记的PCR反应体系和扩增条件不同,这些瑕疵增加了染色体着陆乃至图位克隆其他步骤的工作量,有碍图位克隆的顺利开展。针对上述不足,以InDel多态性位点为基础设计一组标记,专门用于染色体着陆,以弥补现有SSLP标记的不足。这套标记有确切的物理位置,每个标记所控制的染色体区间小于30 cM,而且这套标记可采用相同的PCR反应体系和反应程序。随即用这套标记成功地实现了6个Ler背景的隐性突变体的染色体着陆,显示这组标记能够满足实验要求,使得拟南芥图位克隆得到简化。

关 键 词：拟南芥 图位克隆 SSLP  染色体着陆  In  Del标记  分离群体分组分析(BSA)  

分 类 号：Q37]