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福建NADC30-like PRRSV FJLY01株的全基因组分子特征分析
Molecular characterization of NADC30-like PRRSV isolate FJLY01 from Fujian
文献类型:期刊文章
WEI Chunhua LIU Jiankui DAI Ailing GONG Lizhen LI Xiaohua HUANG Siqiong YANG Xiaoyan(Fujian Provincial Key Laboratory for the Prevention and Control of Animal Infectious Diseases and Biotechnology ,Fujian Engineering Research Center for Swine Disease Control and Prevention, College of Life Sciences ,Longyan University ,Longyan ,Fujian 364000 ,Chin)
机构地区:[1]龙岩学院生命科学学院,福建省家畜传染病防治与生物技术重点实验室,福建省生猪疫病防控工程技术研究中心,福建龙岩364000
基 金:福建省科技厅重大专项专题项目(2014NZ0002);福建省省属高校科研课题(JK2015049);福建省自然科学基金项目(2016J01168);福建省科技平台项目(2014N2011)
年 份:2017
卷 号:45
期 号:3
起止页码:51-60
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2014、CAB、CSCD、CSCD2017_2018、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:【目的】了解福建省NADC30-like PRRSV FJLY01株的分子生物学特征和遗传演化规律,为PRRSV的防控提供参考。【方法】对采自福建省规模化猪场的疑似病料进行PRRSV分离鉴定,以NADC30PRRSV毒株基因序列为参考设计并合成9对引物,分别对分离株序列进行分段PCR扩增,经克隆测序后进行序列拼接,采用MEGA 6.0软件进行核苷酸及氨基酸同源性比对,并绘制其与其他35株毒株的系统遗传进化树。【结果】FJLY01株基因组全长为15 016bp(不包含polyA),包含10个开放阅读框,5′-UTR长190bp,3′-UTR长148bp,Nsp2基因缺失393bp。Nsp2蛋白存在类似PRRSV MN184和NADC30株的131个氨基酸的缺失。核苷酸比对结果表明,FJLY01株与VR-2332、MLV RespPRRS/Repro、CH-1a和BJ-4株核苷酸的同源性为85.2%~86.3%,与JXA1、HuN4等HP-PRRSV株核苷酸的同源性为83.7%~84.1%,与MN184A、MN184B株核苷酸的同源性为87.9%~88.2%,与NADC30株核苷酸的同源性最高,为97.1%。系统进化树分析表明,该毒株属于NADC30-like毒株,与JXA1、VR2332和CH-1a的亲缘关系较远。【结论】福建省存在NADC30-like毒株,应该加强PRRSV的监测。
关 键 词:PRRSV 全基因组 NADC30-like 福建省
分 类 号:S528.65]
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