期刊文章详细信息
山葡萄COR413家族基因克隆及其参与低温胁迫的表达分析
Cloning and Expression Analysis of COR413 Family Genes from Vitis amurensis in Response to Cold Stress
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]宁夏大学农学院/葡萄与葡萄酒教育部工程研究中心/宁夏葡萄与葡萄酒研究院/宁夏葡萄与葡萄酒工程技术研究中心,银川750021
基 金:国家自然科学基金地区科学基金项目(No.31560550);园艺学"十三五"自治区优势特色学科建设(2015)110
年 份:2017
卷 号:25
期 号:3
起止页码:366-377
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2014、CAB、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2017_2018、JST、RCCSE、UPD、ZGKJHX、核心刊
摘 要:冷适应蛋白(cold-regulated,COR413)基因作为植物特有的一类低温胁迫响应功能基因,在抗寒过程中发挥重要作用。为了鉴定葡萄属(Vitis)植物COR413基因参与低温胁迫响应的功能特点,本研究基于欧洲葡萄基因组数据库挖掘,采用同源克隆法获得了抗寒种质山葡萄(Vitis amurensis)COR413基因家族成员的4条序列,分别命名为Va COR413-PM2A、-PM1X1、-IM1与-PM2B。经序列分析表明,所克隆的4条山葡萄COR413基因家族成员与欧洲葡萄相应基因的核苷酸与氨基酸序列高度同源,其核苷酸序列的差异仅为个别单核苷酸的替代。所克隆的4个山葡萄冷适应蛋白家族基因均含有WCOR413保守结构域、跨膜结构域与丝/苏/酪氨酸磷酸化位点,其中仅Va COR413-PM1X1含有一个预测的N端信号肽序列,仅Va COR413-PM2B包含1个糖基化磷脂酰肌醇锚点。源于2个葡萄种质中COR413基因家族成员可以聚类为2个明显的簇,COR413-PM2A,-PM1X1与-PM2B聚类在一簇,而COR413-IM1分布在另外一簇。半定量RT-PCR组织特异性检测结果表明,Va COR413-PM2A、-PM1X1、-IM1与-PM2B在山葡萄不同组织和器官中表达存在差异,且不同于欧洲葡萄相应基因的表达模式;其中山葡萄Va COR413-PM2A、-PM1X1、-IM1与-PM2B在所有检测的组织中均表达且强度不同,Va COR413-PM2A与-PM1X1在嫩梢、卷须、花絮以及幼叶中表达量较高。在低温胁迫条件下,山葡萄COR413基因家族4个成员参与低温胁迫的表达模式分为2类,而欧洲葡萄中相应成员有3种模式;山葡萄Va COR413-IM1受低温胁迫24 h表达量最高,为对照的9.57倍,而欧洲葡萄Vv COR413-IM1在低温胁迫3 h后的表达量较高,约为对照的3.65倍。低温胁迫下的表达数据表明,山葡萄COR413基因家族成员中聚类为一簇的Va COR413-PM2A,-PM1X1与-PM2B响应低温总体呈下调表达,其表达幅度均低于欧洲葡萄相应基因的表达量,而聚类在另外一簇的Va COR413-IM1对低温胁迫(24 h)响
关 键 词:抗寒性 冷适应蛋白基因(COR413) 山葡萄 组织特异表达 低温胁迫
分 类 号:S663.1]
参考文献:
正在载入数据...
二级参考文献:
正在载入数据...
耦合文献:
正在载入数据...
引证文献:
正在载入数据...
二级引证文献:
正在载入数据...
同被引文献:
正在载入数据...