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期刊文章详细信息

基于高通量测序分析海带表面细菌群落结构    

Characterization of bacterial community structure on surface of kelp Saccharina japonica by high-throughput sequencing

  

文献类型:期刊文章

作  者:孙丕海[1] 钱坤[2] 李晓丽[3] 杨志平[4] 丁鉴锋[3] 孙雪莹[3] 马悦欣[3]

机构地区:[1]大连海洋大学海珍品苗种培育基地,辽宁大连116023 [2]大连金普新区海洋与渔业局,辽宁大连116100 [3]大连海洋大学农业部北方海水增养殖重点实验室,辽宁大连116023 [4]大连汇新钛设备开发有限公司,辽宁大连116039

出  处:《大连海洋大学学报》

基  金:辽宁省自然科学基金资助项目(2015020800);大连市金州新区海洋与渔业局项目(2014115;2014118)

年  份:2017

卷  号:32

期  号:1

起止页码:7-12

语  种:中文

收录情况:AJ、BDHX、BDHX2014、CAB、CAS、CSA、CSCD、CSCD_E2017_2018、JST、PROQUEST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘  要:为研究大连登沙河湾和正明寺海带养殖区海带Saccharina japonica表面及其周围海域海水的细菌群落结构,分别于2015年1月、2月和4月,采用Illumina Miseq PE300高通量测序平台对样本基因组DNA的16S r RNA基因V3~V4区PCR扩增片段进行测序分析。结果表明:从两个海区健康海带和海水中获得优化序列分别为130 158条和124 658条,海带序列可归为8个门和99个属,海水序列可归为14个门和135个属;在门水平,海带首要优势门为厚壁菌门(>69%),其次为变形菌门、蓝细菌门、放线菌门和拟杆菌门(>1%),海水首要优势门为变形菌门(>46%),其次为厚壁菌门、拟杆菌门、蓝细菌门和放线菌门(>1%);在属水平,海带主要优势属为乳球菌属(>40%)和芽孢杆菌属(>10%),其次为Solibacillus、假单胞菌属和节杆菌属(>3%),海水首要优势属为弧菌属(21.58%)和乳球菌属(28.29%),其次为科尔韦尔氏菌属、弓形杆菌属和亚硫酸杆菌属(>2%)。研究表明,两个海区海带细菌群落组成相似,海带和海水细菌群落组成则明显不同。

关 键 词:海带 细菌群落 高通量测序

分 类 号:Q939.1]

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