文献类型：期刊文章

作　　者：刘华[1] 施婷婷[1] 施志仪[2]

机构地区：[1]南宁富莱欣生物科技有限公司研发中心,广西南宁530003 [2]上海海洋大学生物技术研究中心,上海200090

出　　处：《广东农业科学》

基　　金：国家自然科学基金(30271017);国家高等教育博士项目科研基金(20040264001)

年　　份：2016

卷　　号：43

期　　号：12

起止页码：108-114

语　　种：中文

收录情况：CAS、IC、RCCSE、UPD、WOS、ZGKJHX、ZR、普通刊

摘　　要：根据Gen Bank中虹鳟、大菱鲆、斑马鱼及其他生物的精氨酸酶基因序列设计并合成一对引物,并提取变态期牙鲆仔鱼总RNA作为模板进行RT-PCR,得到一条c DNA片段。将产物连接到T载体中,转化、扩增重组质粒。提取大肠杆菌中的重组质粒进行DNA测序。将DNA测序所得到的基因序列翻译成蛋白序列和已知的大菱鲆、鲤鱼、虹鳟、斑马鱼的精氨酸酶基因序列进行同源性分析。结果显示,利用RTPCR的方法扩增出一条284 bp的目的基因片段,比对结果发现,其与大菱鲆、鲤鱼、斑马鱼以及虹鳟精氨酸酶基因蛋白序列的同源性分别为96%、85%、84%和82%。对蛋白序列进行生物信息学分析发现,整个蛋白序列中无信号肽,无糖基化位点,无跨膜结构域,但含有一个典型的arginase结构。在N-端第38-44、57-64、71-76、89-94区段有β-折叠中心;第7-18、50-52、81-87区段可能形成α螺旋区域。Arg蛋白N端第37-45和第74-77区段为优势抗原表位区域。

关 键 词：牙鲆 精氨酸酶 克隆 序列分析  

分 类 号：S917[水产类]