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基于宏基因组学16S rDNA测序对烟草根际土壤细菌群落组成分析
Analysis of Bacterial Community Structure in Rhizosphere Soil of Tobacco based on the Metagenomics 16S rDNA Sequencing Technology
文献类型:期刊文章
CHANG Anran LI Jia(College of Tobacco Seienee, Henan Agricultural University, Zhcngzhou 450002 Fuzhou Tobacco Company of Jiang'xi Province, Jiangxi Fuzhou 344000, China)
机构地区:[1]河南农业大学烟草学院,郑州450002 [2]江西省烟草公司抚州市公司,江西抚州344000
基 金:河南省烟草公司资助项目(HYKJ201301)资助
年 份:2017
卷 号:19
期 号:2
起止页码:43-50
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2014、CAB、CAS、CSCD、CSCD_E2017_2018、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:为了研究烟草根际土壤细菌多样性,了解其细菌群落的组成和结构,从而为健康植烟土壤生态系统的构建和保持提供理论依据和指导。以2014年四川凉山州健康烟株现蕾期根际土壤为研究样本,利用Illumina平台Miseq高通量测序技术对烟草根际土壤细菌16S rDNA进行高通量测序分析。结果表明:烟草根际土壤微生物多样性水平较高,不同样品间主要菌落分布结构相对稳定。在门分类水平上,共检测分类25个菌门,其中变形菌门占有明显优势(39.04%~53.71%),其次为拟杆菌门、酸杆菌门、疣微菌门;在属分类水平上,共检测分类576类菌属,鞘脂单胞菌属、Flavisolibacter、Ohtaekwangia为烟草根际土壤细菌明显优势菌属。大部分主要菌群之间存在明显正相关关系,对烟草根际土壤细菌影响较大的环境因子为土壤速效氮、含水量和pH。运用宏基因组学16S rDNA测序技术获取的烟草根际土壤细菌信息较为丰富,为健康植烟土壤机制研究提供新的理论参考。
关 键 词:烟草 根际土壤 细菌 宏基因组学 冗余度分析
分 类 号:S572]
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