期刊文章详细信息
陆地棉Pht1家族成员的全基因组鉴定及表达分析
Genome-Wide Identification and Expression Analysis of Pht1 Family Genes in Cotton(Gossypium hirsutum L.)
文献类型:期刊文章
Chao Maoni Zhang Zhiyong Song Haina Li Chengqi Zhang Xin Hu Genhai Zhang Jinbao Wang Qinglian(College of Life Science and Technology, Henan Institute of Science and Technology / Henan Collaborative Innovation Center of Modem Biological Breeding, Xinxiang, Henan 453003, China Pingdingshan University, Pingdingshan, Henan 467000, China)
机构地区:[1]河南科技学院生命科技学院/现代生物育种河南省协同创新中心,河南新乡453003 [2]平顶山学院,河南平顶山467000
基 金:国家自然科学基金(31601347);河南省高等学校重点科研项目计划(15A210001);河南科技学院高层次人才计划(2014004)
年 份:2017
卷 号:29
期 号:1
起止页码:59-69
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2014、CAB、CSCD、CSCD2017_2018、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:【目的】磷是植物三大必需矿质元素之一,对植物的生长发育至关重要。Pht1家族的磷酸盐转运蛋白在植物磷吸收和转运方面具有重要作用,然而关于该基因的系统研究工作尚很少开展。本研究旨在进行Pht1家族成员全基因组鉴定和表达模式分析。【方法】通过生物信息学的方法对陆地棉Pht1家族成员的基因结构、编码蛋白质的结构、染色体定位、基因复制和表达情况等进行全面分析。【结果】(1)在陆地棉的基因组中共鉴定到17个磷酸盐转运蛋白基因(GhPT),其中A亚组包含8个GhPT,D亚组包含9个GhPT;(2)棉花GhPT蛋白之间序列相似性很高,并均具有12个疏水的跨膜区域;(3)进化分析表明这些GhPT蛋白主要聚为2大组(GroupⅠ和GroupⅡ),位于同一组的GhPT的编码基因大部分具有相似的内含子/外显子分布模式;(4)17个GhPT基因不均匀分布在A亚组和D亚组中的5条染色体上,串联复制和片段复制可能导致GhPT基因在陆地棉中的扩增;(5)表达模式分析表明,GhPT6和GhPT14在根中表达量最高,且同时响应低磷和低钾胁迫诱导并上调表达。【结论】这些结果将有助于深入了解Pht1家族基因的功能及离子信号途径相互作用的分子机制。
关 键 词:陆地棉 基因家族 GhPT基因 磷酸盐转运蛋白 进化分析 表达模式
分 类 号:S562]
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