文献类型：期刊文章

作　　者：冀俊忠[1] 高光轩[1]

机构地区：[1]北京工业大学信息学部多媒体与智能软件技术北京市重点实验室,北京100124

出　　处：《北京工业大学学报》

基　　金：国家自然科学基金资助项目(61375059)

年　　份：2017

卷　　号：43

期　　号：1

起止页码：13-21

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2014、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD_E2017_2018、IC、INSPEC、JST、MR、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、ZMATH、核心刊

摘　　要：为了解决蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络功能模块检测问题,提出一种基于文化算法的PPI网络功能模块检测(CA-FMD)方法.首先,每个个体采用基于节点邻居有序表的编码方式表示功能模块检测问题的一个可行解.然后,利用文化算法的双层进化机制获得最优解,其中,上层机制用来模拟信念空间中群体经验的进化,下层机制用来刻画种群空间中个体的进化.最后,借助2个空间的相互作用和影响完成解的优化.在3个数据集上的实验结果表明:与其他算法相比,CA-FMD方法在多项评价指标上都具有明显的优势.

关 键 词：蛋白质相互作用网络 功能模块检测  文化算法

分 类 号：Q811.4[生物工程类] TP301.6]