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期刊文章详细信息

沙棘WRI1转录因子基因的生物信息学分析    

Bioinformatics Analysis of WRI1 Gene in Hippophae rhamnoides

  

文献类型:期刊文章

作  者:马倩[1] 李景滨[1] 阮成江[1] 李荣荣[1]

机构地区:[1]大连民族大学环境与资源学院/资源植物研究所,辽宁大连116600

出  处:《湖北农业科学》

基  金:国家自然科学基金项目(31570681)

年  份:2016

卷  号:55

期  号:22

起止页码:5972-5975

语  种:中文

收录情况:JST、ZGKJHX、普通刊

摘  要:以构建的沙棘(Hippophae rhamnoides Linn.)不同组织转录组数据库为基础,分离得到1个沙棘WRI1转录因子编码基因,命名为Hr WRI1,利用生物信息学方法对其基因结构、理化性质、保守域、信号肽、亚细胞定位、磷酸化位点和高级结构等进行了预测和较为全面的分析。结果表明,该成员含有1 206 bp的完整开放阅读框,编码401个氨基酸组成的不稳定亲水蛋白,无信号肽和跨膜结构域,存在多个磷酸化位点,定位于细胞核中,高级结构以无规则卷曲为主。与不同植物中已报道的同源WRI1转录因子进行多重序列比对后,发现它们在核酸与氨基酸水平均高度同源,并且具有相同的结构域。

关 键 词:沙棘(Hippophae  rhamnoides  Linn.)  WRI1基因  生物信息学

分 类 号:Q943.2[植物生产类]

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同被引文献:

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