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期刊文章详细信息

苏云金芽孢杆菌HS66的转座因子分析    

Analysis of the Transposable Elements of Bacillus thuringiensis HS66

  

文献类型:期刊文章

作  者:张文飞[1] 贾璐羽[1] 龚建如[1] 吴仲琦[2,3] 梅思钰[1] 晋雪琪[1] 李小影[1] 刘娅[1] 王学智[1] 邱海芳[1] 金映虹[1] 吴红萍[1] 杨勇[1] 王锐萍[1]

机构地区:[1]海南师范大学生命科学学院,热带动植物生态学省部共建教育部重点实验室,海口571158 [2]东北林业大学盐碱地生物环境研究中心,东北油田盐碱植被与恢复教育部重点实验室,哈尔滨150040 [3]浙江农林大学暨阳学院生命科学研究所,诸暨311800

出  处:《基因组学与应用生物学》

基  金:海南省自然科学基金(314077);海南省应用技术研发与示范推广专项(ZDXM2015018);国家自然科学基金(31560527);海南师范大学大学生创新创业训练计划项目(301010106082,301010106079,XSKY201515)共同资助

年  份:2016

卷  号:35

期  号:12

起止页码:3419-3424

语  种:中文

收录情况:AJ、BDHX、BDHX2014、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2015_2016、JST、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘  要:移动遗传因子普遍存在于苏云金芽孢杆菌(Bt)基因组中,而且大部分位于Bt毒素基因两侧附近,与Bt毒素基因进化和转移密切相关。本研究完成了一株对鳞翅目昆虫表现出很强的杀虫活性的Bt菌株HS66的基因组序列草图测定,并利用本地BLAST软件和ISFinder软件,进行了插入序列和转座子序列的查找及基本信息的汇总,结果表明Bt HS66基因组序列含有丰富的插入序列和转座子序列。转座因子分析是整个Bt HS66基因组分析过程中的重要的一环,后续工作中若定位移动因子在染色体及质粒序列的位置,对解析转座因子功能,帮助预测相关杀虫基因信息,以及全面理解Bt HS66基因组将有极大的帮助。

关 键 词:插入序列  转座子 Illuraina测序  苏云金芽孢杆菌

分 类 号:S476] Q78]

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