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期刊文章详细信息

基于高通量测序的肉牛垫料养殖床中细菌群落分析    

  

文献类型:期刊文章

作  者:周德平[1,2] 褚长彬[1] 赵峥[1] 姜震方[1] 吴淑杭[1]

机构地区:[1]上海市农业科学院生态环境研究所,201403 [2]上海东保农业科技有限公司,上海市闵行区201106

出  处:《上海农业科技》

基  金:崇明区科技攻关项目(编号:CK2014-11)

年  份:2016

期  号:6

起止页码:26-27

语  种:中文

收录情况:普通刊

摘  要:利用Roche 454GSFLX+高通量测序平台分析了肉牛垫料养殖床中的细菌群落结构,结果显示,从发酵床样品中共获得17 772条有效序列,其中优质序列有13 301条,在97%相似水平上聚为1 603个OTU分类单元;目水平上,细菌优势种群集中在芽孢杆菌目(21.70%)、红螺菌目(18.20%)、乳杆菌目(14.90%)、梭菌目(14.10%)、黄杆菌目(10.50%)、伯克氏菌目(5.50%)、黄单胞菌目(3.00%)、放线菌目(2.10%)和根瘤菌目(1.80%);属水平上,细菌的优势种群主要集中于醋酸杆菌属(15.17%)、金黄杆菌属(9.50%)、乳杆菌属(6.90%)、芽孢杆菌属(6.30%)、乳球菌属(6.0%)、高温放线菌属(3.50%)、类芽孢杆菌属(2.40%)、梭菌目(2.10%)、伯克氏菌属(2.10%)和葡萄糖醋杆菌属(1.80%)。

关 键 词:垫料养殖  肉牛 细菌种群结构  高通量测序

分 类 号:S852.7]

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