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81株铜绿假单胞菌16S rRNA基因序列测定及系统发育学分析
Identification of 81 Pseudomonas aeruginosa by phylogenetic analysis of 16S rRNA gene sequence
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]广东省食品检验所,广东广州510435 [2]广东省酒类检测中心,广东广州510435
年 份:2016
卷 号:32
期 号:11
起止页码:21-24
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2014、CSCD、CSCD2015_2016、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:采用16SrRNA基因序列分析法对2015年7-9月广东省食品检验所桶装水专项抽检中筛查所得的81株铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)进行复核鉴定。菌株经纯化培养后提取总DNA,采用细菌16SrRNA通用引物进行16SrRNA基因序列扩增,PCR扩增产物经2%琼脂糖凝胶电泳后,进行序列测定,序列经人工校对后用Clustal X进行比对分析,最后用MEGA5.1软件构建系统发育树。系统发育分析结果 表明:81株铜绿假单胞菌与原鉴定结果一致。其中,编号24-3-QY、100-5-JM、106-3-JM菌株形成一个分支,28-1-WD单独为一支,其余77株野生菌和铜绿假单胞菌标准菌株ATCC27853聚为一群。该研究是2015年5月24日中国开始实施GB 19298—2014《食品安全国家标准包装饮用水》以来,广东省首次对水源性铜绿假单胞菌进行的研究,为下一步菌种污染朔源等研究提供依据。
关 键 词:铜绿假单胞菌 16S RRNA基因 序列分析 系统发育树
分 类 号:R123.1]
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