文献类型：期刊文章

作　　者：樊文强[1,2] 盖红梅[3] 孙鑫[1,2] 杨爱国[1] 张忠锋[1] 任民[1]

机构地区：[1]中国农业科学院烟草研究所烟草遗传改良与生物技术重点开放实验室,青岛266101 [2]中国农业科学院研究生院,北京100081 [3]青岛市农业科学研究院,青岛266100

出　　处：《分子植物育种》

基　　金：烟草基因组计划重大专项(110201301008);国家自然科学青年基金(31301320);作物生物学国家重点实验室开放课题(2013KF12)共同资助

年　　份：2016

卷　　号：14

期　　号：1

起止页码：265-270

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2014、CAB、CAS、CSCD、CSCD2015_2016、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：随着分子群体遗传学的快速发展和SSR标记的广泛应用,一些分子群体遗传学分析软件相继问世。但是不同软件的SSR数据输入文件格式并不一致,人工转换费时费力,且易出错。因此,本研究利用Python高级计算机语言开发了SSR分子标记数据格式转换软件Data Formater。该软件具有友好的图形用户界面,能高效准确的把SSR原始数据快速转换为Popgene、Ntsys、Power Marker、Structure、Tassel、SPAGe Di等常用分子群体遗传学分析软件的输入文件,同时还具过滤稀有等位、过滤无多态位点、用户数据校验等功能。与人工转换相比,Data Formater可大大提高转换的效率和准确性。因此,Data Formater将是分子群体遗传学研究中不可或缺的工具软件。现在用户可以通过Data Formater软件的主页进行下载,网址为:www.ycsjk.com.cn/dataformater/home/,或通过电子邮件renmin@caas.cn索取该软件。

关 键 词：分子群体遗传学 分子标记 SSR 数据格式 软件  Python计算机语言  

分 类 号：TP319] Q75[计算机类]