文献类型：期刊文章

作　　者：葛怡情[1] 曹玲珍[1]

机构地区：[1]江西师范大学生命科学学院,鄱阳湖湿地与流域研究教育部重点实验室,南昌330000

出　　处：《四川动物》

基　　金：鄱阳湖湿地与流域研究教育部重点实验室(江西师范大学)开放基金项目(PK2013001);江西省教育厅课题“基于线粒体分子标记的江西黄蜻遗传多样性研究”项目(7357)

年　　份：2016

卷　　号：35

期　　号：6

起止页码：852-859

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2014、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘　　要：利用RNA-seq技术对黄蜻Pantala flavescens(Fabricius)头部细胞的全部转录本进行测序、功能分析。提取黄蜻头部总RNA,反转录得到c DNA,在Illumina平台上进行测序,经拼接、组装、聚类后获得全部unigenes,并将所得的unigenes与数据库比对,对其进行功能注释和分类。总共得到47 039 040条碱基序列,包含了7 102 895 040个碱基序列信息,碱基G和C的数量总和占总碱基数量的44.05%。将测序结果进行组装,组装所得到的unigenes为34 406 502条,对所得到的unigenes进行不同的数据库注释,共有44 499条unigenes被注释到数据库,其中有大量unigenes与代谢过程、结合活性、催化活性和细胞进程有关。与COG数据库比对,根据功能可以分为26类,其中信号转导机制最为丰富。与KEGG数据库比对,线粒体基因在所测样本中最为丰富,与KEGG ORTHOLOGY注释后,代谢活动基因最为丰富。这些与线粒体和代谢有关的基因与我们研究中与黄蜻迁飞基因相关,为后续研究奠定了基础。

关 键 词：黄蜻  转录组 测序 基因分析 功能注释

分 类 号：Q963]