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期刊文章详细信息

红椿SSR-PCR体系建立和多态性引物筛选    

Establishment and Primer Screening of SSR-PCR Reaction System for Toona ciliata

  

文献类型:期刊文章

作  者:湛欣[1] 鲁好君[1] 赵帅[1] 陈晓阳[1] 邓小梅[1]

机构地区:[1]华南农业大学林学与风景园林学院/广东省森林植物种质创新与利用重点实验室,广东广州510642

出  处:《林业科学研究》

基  金:国家林业局公益性行业专项(201004020)

年  份:2016

卷  号:29

期  号:4

起止页码:565-570

语  种:中文

收录情况:AJ、BDHX、BDHX2014、BIOSISPREVIEWS、CAB、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2015_2016、GEOBASE、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘  要:[目的]本研究旨在建立红椿SSR-PCR最佳反应体系,并筛选适于红椿SSR分析的高多态性引物。[方法]通过L16(45)正交试验设计,确立红椿SSR-PCR最佳反应体系;利用优化后的体系对来自楝科植物的135对SSR引物,在6个不同的红椿居群中进行扩增,筛出能有效扩增的引物并进一步筛选出适于红椿的高多态性引物。[结果](1)10μL基于荧光d UTP的SSR-PCR体系中包含:10×buffer 1.0μL,Taq酶(5 U·μL-1)0.1μL,Mg Cl2(25mmol·L-1)0.8μL,d NTP(200 mmol·L-1)0.025μL,荧光d UTP(1 nmol·μL-1)0.01μL,引物(10 mmol·L-1)0.8μL,DNA模板45 ng剩余用dd H2O补足;(2)筛选出29对能有效扩增的引物,复选后获得了12对适于红椿SSR分析的高多态性引物。[结论]建立了SSR-PCR最佳反应体系并筛选出高多态性引物,为红椿的分子标记等遗传学研究提供了基础。

关 键 词:SSR 红椿 体系优化  引物筛选

分 类 号:S792.99]

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同被引文献:

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