期刊文章详细信息
变形假单胞菌2-酮基葡萄糖酸转运蛋白基因的克隆与分析 ( EI收录)
Cloning and Bioinformatic Analysis of a 2-Ketogluconate Transporter Gene from Pseudomonas plecoglossicida
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]江苏大学食品与生物工程学院,江苏镇江212013 [2]百勤异VC钠有限公司,江西德兴334221 [3]江南大学生物工程学院,江苏无锡214122
基 金:国家自然科学基金项目(31571885);国家高技术研究发展计划项目(2012AA022103);江西省科技计划项目(赣知发[2015]64号);江苏大学研究生科研创新计划项目(KYXX_0046);江苏大学大学生科研立项项目(13A083);德兴市科技计划项目(德科发[2015]44号)
年 份:2016
卷 号:32
期 号:6
起止页码:50-55
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2014、CAB、CAS、CSA-PROQEUST、EI、FSTA、IC、PROQUEST、RCCSE、SCOPUS、UPD、ZGKJHX、核心刊
摘 要:该研究旨在克隆变形假单胞菌JUIM01的2-酮基葡萄糖酸转运蛋白基因kgu T,并明确其基本的生物学信息。根据已报道的假单胞菌的基因组信息及其2-酮基葡萄糖酸操纵子的物理图谱设计简并引物,采用TD-PCR技术从变形假单胞菌中克隆到全长为1278 bp的kgu T,其核苷酸序列与Pseudomonas sp.CCOS191的编码2-酮基葡萄糖酸转运蛋白(Kgu T)的核苷酸序列的一致性为87%,编码一个由425个氨基酸残基组成的蛋白。该蛋白与Pseudomonas sp.M1的Kgu T在氨基酸序列上的一致性达90%,定位于细胞膜,是一个具有12个跨膜结构的疏水性的跨膜蛋白,无信号肽,其二级结构中α螺旋、延伸链和无规卷曲所占的比例分别为75.76%、2.12%和22.12%。本研究首次从2-酮基葡萄糖酸的工业生产用菌中克隆到基因kgu T,并对其进行了生物信息学分析,为变形假单胞菌的Kgu T的功能研究奠定了基础。
关 键 词:变形假单胞菌 2-酮基葡萄糖酸转运蛋白 kgu T基因 克隆 生物信息学
分 类 号:Q933]
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