文献类型：期刊文章

作　　者：陈晨[1] 郝莎[1] 白杨[1] 张健萍[1] 张孝兵[1,2,3,4] 程涛[1,2,3,5]

机构地区：[1]中国医学科学院北京协和医学院血液病医院血液学研究所,实验血液学国家重点实验室,天津300020 [2]中国医学科学院干细胞医学中心,天津300020 [3]北京协和医学院干细胞与再生医学系,天津300020 [4]Department of Medicine,Loma Linda University [5]肿瘤医学协同创新中心,天津300020

出　　处：《中国科学：生命科学》

基　　金：国家自然科学基金(批准号:81421002;81300374;31301206);北京协和医学院"协和青年科研基金"(批准号:3332015183)资助

年　　份：2016

卷　　号：46

期　　号：7

起止页码：839-850

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2014、CSCD、CSCD2015_2016、JST、PUBMED、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：CRISPR/Cas9-sg RNA(single guide RNA)全基因组文库筛选技术是在哺乳动物中进行系统基因组分析的有力工具.本文通过在人急性单核白血病细胞系THP1上优化CRISPR/Cas9-sg RNA人类全基因组慢病毒文库感染体系,构建裸鼠皮下移植肿瘤模型,并通过优化测序建库方法,对肿瘤组织进行二代测序以及利用生物信息学分析获得筛选结果.裸鼠肿瘤模型表明,感染sg RNA文库后的THP1细胞成瘤能力下降,推测可能与某些促癌基因的敲除有关;通过对二代测序数据进行生物信息学分析得到了一些候选基因.实验结果表明,在人单核细胞白血病细胞系上进行CRISPR/Cas9-sg RNA全基因组文库筛选是可行的,这项工作为在其他白血病细胞系或原代细胞上的筛选应用奠定了一定基础.

关 键 词：CRISPR/Cas9  sgRNA  THP1  基因筛选 二代测序  

分 类 号：Q78] R733.7]