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期刊文章详细信息

目标-诱饵库搜索策略在蛋白质组质谱鉴定和质控中的应用及研究进展  ( SCI收录)  

The Application and Progress of Target-decoy Database Search Strategy in Identification and Quality Control of Tandem Mass Spectrometry Data in Shotgun Proteomics

  

文献类型:期刊文章

作  者:冯晓东[1,2] 马洁[2] 常乘[2] 白明泽[1] 朱云平[2] 舒坤贤[1]

机构地区:[1]重庆邮电大学生物信息学研究所,重庆400065 [2]军事医学科学院放射与辐射医学研究所,蛋白质药物国家工程研究中心,北京蛋白质组研究中心,蛋白质组学国家重点实验室,国家蛋白质科学中心(北京),北京102206

出  处:《生物化学与生物物理进展》

基  金:国际合作计划(2014DFB30010);国家重点基础研究发展计划(973)(2013CB910800);国家自然科学基金(21475150,21105121,61501071)资助项目;重庆市研究生科研创新项目(CYS14154)资助

年  份:2016

卷  号:43

期  号:7

起止页码:661-672

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2014、BIOSISPREVIEWS、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2015_2016、IC、JST、RCCSE、SCI(收录号:WOS:000380298600004)、SCI-EXPANDED(收录号:WOS:000380298600004)、SCIE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘  要:基于串联质谱的蛋白质组研究会产生海量的质谱数据,这些数据通常使用数据库搜索引擎进行鉴定分析,并根据肽段谱图匹配(PSM)反推真实的样品蛋白质.对于高通量蛋白质组数据的处理,其鉴定结果的可信是后续分析应用的前提,因此对鉴定结果的质量控制尤为重要,而基于目标-诱饵库(target-decoy)搜索策略的质量控制是目前应用最为广泛的方法.本文首先介绍了基于目标-诱饵库搜索策略搜库和质量控制的实施流程,然后综述了基于目标-诱饵库搜索策略的质量控制工具,并提出了目标-诱饵库搜索策略的不足及改善方法,最后对目标-诱饵库搜索策略进行了总结与展望.

关 键 词:串联质谱 蛋白质鉴定 目标-诱饵  质量控制  

分 类 号:Q51] Q811.4

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同被引文献:

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