文献类型：期刊文章

作　　者：张晓盼[1] 宋婕[1] 焦雄[1]

机构地区：[1]太原理工大学力学学院,应用力学与生物医学工程研究所,太原030024

出　　处：《医用生物力学》

基　　金：国家自然科学基金项目(31070828,31300770);博士后科学基金项目(2012T50247,20100471587);山西省自然科学基金项目(2009021018-2,2013021003-2)

年　　份：2016

卷　　号：31

期　　号：3

起止页码：213-217

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2014、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2015_2016、EI、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、UPD、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的运用生物信息学方法预测整合素黏附体信号蛋白间的信号转导通路,为以实验方法研究整合素相关信号转导通路的机制提供参考。方法把相互作用的整合素黏附体信号分子对搭建成相互作用网络;利用相互作用的置信概率构建边权;然后,采用动态规划算法计算出最小权重的线性通路,再把这些线性通路组装成通路网络。结果从147个整合素黏附体蛋白所组成的736对相互作用中预测出7个信号通路网络,并计算出各个通路网络中基因本体论注释蛋白的占有率。结论对信号转导通路的研究能够在分子水平上探索疾病的发病机制。预测出可能的信号通路网络,不仅为基础医学研究疾病机制提供有用信息,也为探索包括力学、化学等外界信号刺激下的信号转导通路提供有益参考信息。

关 键 词：整合素黏附体  信号转导通路 动态规划算法

分 类 号：R318.01[生物医学工程类]