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期刊文章详细信息

人G1型轮状病毒TaqMan荧光定量检测方法的建立与应用    

Establishment and application of TaqMan real-time fluorescence quantitative PCR for G1 serotype rotavirus detection

  

文献类型:期刊文章

作  者:彭杰[1,2] 胡晓星[2] 冯悦[2] 甸子芩[1] 孙鷖[1] 牛华[1] 夏雪山[2]

机构地区:[1]昆明理工大学医学院昆明理工大学附属医院,昆明650500 [2]昆明理工大学生命科学与技术学院云南省分子医学研究中心,昆明650500

出  处:《中国人兽共患病学报》

基  金:国家科技支撑计划项目(No.2014BAI01B01)~~

年  份:2016

卷  号:32

期  号:6

起止页码:512-517

语  种:中文

收录情况:AJ、BDHX、BDHX2014、CAB、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2015_2016、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘  要:目的本研究旨在建立一种快速准确定量检测人G1型轮状病毒的TaqMan探针荧光实时PCR检测方法。方法以轮状病毒VP6基因为靶基因,分别设计2对引物及其相应的TaqMan探针,扩增目的片段,将目的片段克隆于PCDNA3.1+载体上,体外转录获得RNA,系列稀释后为标准品,建立TaqMan探针荧光定量实时PCR检测方法并对该方法进行验证。结果设计实验找到最优条件下的引物浓度(250nmol/L)、探针浓度(300nmol/L);通过对引起腹泻的人柯萨奇病毒、呼肠孤病毒等进行检测,结果均为阴性,表明该方法具有很好的特异性。该方法的最低检测量为5copies/μL。对该方法进行重复性实验,发现变异率均小于1%,重复性好。用已建立的方法对4份粪便临床样品进行3次重复试验,病毒RNA的检出率为100%。结论本实验初步建立了人G1型轮状病毒TaqMan探针荧光实时PCR检测方法,为G1型轮状病毒的诊断、检测和分子流行病学研究提供了一种新的方法。

关 键 词:人轮状病毒 VP6基因 TaqMan荧光定量PCR  

分 类 号:R373]

参考文献:

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同被引文献:

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