登录    注册    忘记密码

期刊文章详细信息

基于转录组测序的马尔尼菲青霉菌实时荧光定量PCR内参基因筛选与鉴定    

Selection and Idetification of Reference Genes for qRT-PCR in Penicillium marneffei based on RNA-Seq

  

文献类型:期刊文章

作  者:陶玉婷[1] 卢姗[1] 王超[1] 王俊杰[1] 康雪晴[1] 蓝秀万[1,2,3,4] 梁晓乐[2] 梁莹[3,5] 何志义[3,6]

机构地区:[1]广西医科大学基础医学院生物化学与分子生物学教研室,南宁530021 [2]广西医科大学基础医学中心实验室,南宁530021 [3]广西高校基础医学研究重点实验室,南宁530021 [4]广西高校生物分子医学研究重点实验室,南宁530021 [5]广西医科大学基础医学院微生物学教研室,南宁530021 [6]广西医科大学第一附属医院呼吸科,南宁530021

出  处:《基因组学与应用生物学》

基  金:国家自然科学基金项目(No.81160195)资助

年  份:2016

卷  号:35

期  号:5

起止页码:1042-1048

语  种:中文

收录情况:AJ、BDHX、BDHX2014、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2015_2016、JST、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘  要:马尔尼菲青霉菌是一种温度依赖性双相型条件致病真菌,可感染免疫缺陷人群,区域流行于东南亚地和我国南方,但其双相转换和致病性分子机制尚不清楚。实时荧光定量PCR是马尔尼菲青霉菌双相转换和致病性分子机制研究的重要手段,但仍缺乏用于马尔尼菲青霉菌实时荧光定量PCR标准化分析理想的内参基因。本研究根据转录组测序数据筛选了四个表达最稳定的Pfp、Rp123、FacpA、DigA基因与传统的内参基因18Sr RNA、β-actin(Act1)、β-tubulin(Btu)作为候选内参基因,用Best Keeper和ge Norm软件进行基因表达稳定性分析。结果表明FacpA和DigA基因在马尔尼菲青霉菌双相转换过程中表达最为稳定,可作为用于马尔尼菲青霉菌实时荧光定量PCR标准化分析的内参基因。

关 键 词:马尔尼菲青霉菌 内参基因 实时荧光定量PCR  DigA基因  FacpA基因  

分 类 号:R379]

参考文献:

正在载入数据...

二级参考文献:

正在载入数据...

耦合文献:

正在载入数据...

引证文献:

正在载入数据...

二级引证文献:

正在载入数据...

同被引文献:

正在载入数据...

版权所有©重庆科技学院 重庆维普资讯有限公司 渝B2-20050021-7
 渝公网安备 50019002500408号 违法和不良信息举报中心