文献类型：期刊文章

作　　者：张少平[1,2] 洪建基[1] 邱珊莲[1] 郑云云[1,2] 张帅[1] 吴松海[1] 何炎森[1] 郑开斌[1,2] 郑加协[1]

机构地区：[1]福建省农业科学院亚热带农业研究所,福建漳州363005 [2]福建省农业科学院作物研究所,福州350013

出　　处：《园艺学报》

基　　金：福建省自然科学基金项目(2013J01097);福建省科技创新平台建设项目(2014N2006);福建省财政专项-省农业科学院科技创新团队项目(CXTD-2-1320);福建省农业科学院青年英才计划项目(YC2015-19)

年　　份：2016

卷　　号：43

期　　号：5

起止页码：935-946

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2014、CAB、CAS、CSCD、CSCD2015_2016、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：为探讨紫背天葵(Gynura bicolor)花青素等物质合成的遗传基础,采用高通量测序技术(Illumina HiSeq 2500)对其嫩叶进行转录组测序,共获得21 387 624个序列读取片段(reads),将测序数据进行序列组装后,获得33 314个单基因簇(Unigene),其中超过1 kb的7 792个Unigene中共检测到2 387个SSR位点。对所得Unigene进行不同数据库注释,22 048和14 417个Unigene分别在Nr和Swiss Prot数据库有同源比对信息,并发现有29个Unigene与花青素合成相关;Pfam功能注释到13 909个Unigene分为5 198类相关蛋白功能区域,有12个Unigene涉及到花青素合成;GO注释到11 613个Unigene分为细胞组分、分子功能及生物学过程等3大类51个功能组,有24个Unigene与花青素合成有关;COG注释到的6 589个Unigene功能系统分为24类,而KOG注释到的13 498个Unigene功能系统分为25类;以KEGG数据库为参考,将4 466个Unigene定位到108个代谢途径分支,其中有47个Unigene与类黄酮生物合成相关。

关 键 词：紫背天葵 转录组 测序 基因分析 功能注释

分 类 号：S567]