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七星瓢虫滞育关联基因的转录组学分析
Transcriptome analysis of diapause-associated genes of Coccinella septempunctata L.
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]福建农林大学植物保护学院,农业部闽台作物有害生物综合治理重点实验室,福州350002 [2]中国农业科学院植物保护研究所,中美生物防治实验室,北京100081
基 金:国家自然科学基金(31572062);国家重点基础研究发展计划(973)项目(2013CB127602);公益性行业(农业)科研专项(201103002)
年 份:2016
卷 号:38
期 号:2
起止页码:238-248
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2014、CSA、CSCD、CSCD_E2015_2016、JST、PROQUEST、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:对七星瓢虫正常发育、滞育以及滞育解除的雌成虫进行RNA测序,并对筛选出来的滞育相关基因进行KEGG通路富集分析,从分子水平解析七星瓢虫滞育发机理。本研究以正常发育产卵、滞育30 d以及滞育贮存30 d后解除产卵的七星瓢虫雌成虫为研究对象,分别抽提RNA,合成c DNA,构建c DNA文库,文库检测合格后在Illummina Hiseq 2500测序仪上进行双向测序。根据测序结果,共获取unigene 82820个。采用两两比较法对正常发育组和滞育组、滞育组和滞育解除组进行差异表达分析,分别获得差异表达基因3501个和1427个。深入分析两组比对结果,将在滞育组上调且滞育解除组下调的unigene定义为滞育关联基因,共有443个基因为滞育关联基因。应用KEGG KAAS在线pathway比对分析工具对滞育关联基因进行通路富集分析,结果发现这些基因主要集中在碳水化合物代谢、脂质代谢以及信号转导等途径中。
关 键 词:七星瓢虫 滞育 转录组测序 滞育关联基因 KEGG分析、碳水化合物代谢
分 类 号:Q963] S476]
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