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苦楝SSR-PCR反应体系优化及引物筛选
Optimization of SSR-PCR Reaction System and Primer Screening of Melia azedarach
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]华南农业大学林学与风景园林学院/广东省森林植物种质创新与利用重点实验室/亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,广东广州510642 [2]北京林业大学生物科学与技术学院,北京100083
基 金:广东省林业科技创新项目(2011KJCX002)
年 份:2016
卷 号:29
期 号:2
起止页码:167-175
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2014、BIOSISPREVIEWS、CAB、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2015_2016、GEOBASE、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:[目的]借鉴以往楝属文献报道的SSR引物,筛选高度多态性、稳定性高、重复性好的苦楝SSR引物,为苦楝遗传图谱构建、QTL定位和分子标记辅助选择育种等研究领域应用奠定基础。[方法]本研究采用单因素法和正交试验设计进行SSR-PCR反应体系优化,并利用该体系以8个不同种源的苦楝基因组DNA为模板,从135对候选SSR引物中进行引物筛选。[结果]苦楝SSR-PCR最优反应体系为:1.0μL 50 ng·μL^(-1)模板DNA,1.2μL 100μmol·L^(-1)引物,1.0μL 10 mmol·L^(-1)d NTPs,0.8μL 25 mmol·L^(-1)Mg^(2+),0.15μL 5 U·μL^(-1)Taq酶,1.5μL 10×Buffer,补dd H2O至15μL;最终筛选出15对具有高度多态性、稳定性高、重复性好的SSR引物。[结论]本研究成功优化了苦楝SSR-PCR反应体系,并成功筛选出15对适用于苦楝的SSR引物。
关 键 词:苦楝 SSR-PCR 体系优化 引物筛选
分 类 号:S823]
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