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中国13个省份结核分枝杆菌5种特异性抗原人T细胞表位多态性分析
Analysis on human T cell epitopes polymorphisms of five specific antigens of Mycobacterium tuberculosis in 13 areas of China
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]南华大学病原生物学研究所,衡阳421000 [2]中国农业大学生物学院微生物学与免疫学系,农业生物技术重点实验室,北京100193 [3]中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室传染病诊治协同创新中心,北京102206
基 金:国家科技重大专项(2013ZX10003006-002-001);国家自然科学基金(81401647)
年 份:2016
卷 号:37
期 号:4
起止页码:553-557
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2014、CAS、CSCD、CSCD2015_2016、EMBASE、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:目的 分析我国结核分枝杆菌复合群(MTBC)临床分离株中GlnA1、Mpt70、LppX、GroES和LpqH 5种抗原编码基因多态性及其人T细胞表位的多态性。方法 选取13个省份临床分离的173株MTBC,采用PCR扩增5种抗原基因,并运用BioEdit软件进行序列比对,分析其人T细胞表位与非表位的变异情况。利用Mega 6.0软件分别计算同义突变率(dS)和非同义突变率(dN)及其比值。结果 173株菌的基因glnA1非表位区出现2个非同义突变位点;基因mpt70表位区出现1个非同义突变位点;基因lpqH表位区表现为1个非同义突变位点和1个同义突变位点;groES在整个基因中未发现任何突变;基因lppX表位区表现为5个非同义突变和1个同义突变位点,其中152位的氨基酸相同位点有9株菌发生了同义突变,表现较高的多态性。同时基因lppX的15个T细胞抗原表位中有7个表位发生了改变,其dN/dS值为0.19。结论 结核分枝杆菌抗原Mpt70、LppX和LpqH的人T细胞表位区具有多态性,反映了此抗原可能参与逃避宿主免疫的分化选择。GlnA1的非表位区的多态性,对该菌株的免疫反应影响较小。GroES序列相对保守,不具有明显的多态性,可能对结核分枝杆菌的鉴定、诊断及新型疫苗的研制具有重要作用。
关 键 词:结核分枝杆菌复合群 特异性抗原 T细胞表位 多态性
分 类 号:R52]
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