文献类型：期刊文章

作　　者：严海月[1] 张东明[1] 刘大海[1]

机构地区：[1]安徽大学生命科学学院干细胞及转化医学研究中心,合肥230601

出　　处：《基因组学与应用生物学》

基　　金：安徽省自然科学基金面上项目(1508085MH189);国家自然科学基金面上项目(Y06050525)共同资助

年　　份：2016

卷　　号：35

期　　号：3

起止页码：490-502

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2014、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2015_2016、JST、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘　　要：敲除β-catenin基因的第3号外显子可使其过表达。以往很多研究主要通过基因表达谱分析β-catenin过表达对肾脏发育产生的影响,并鉴定了多个关键基因。但相关通路及相关通路间的共表达模式(co-expression pattern)很少被涉及。本研究选取公共数据库GEO(gene expression omnibus)中和小鼠β-catenin过表达肾脏转录组密切相关微阵列(microarray)数据集作为研究对象,并进行GSEA(gene set enrichment analysis)分析,筛选相关转录因子。我们鉴定出了63条被β-catenin上调的通路如Notch信号通路(Notch signaling pathway),以及43条被下调的通路如ABC转运体(ABC transporters)等通路。最终,我们构建了包含有核心基因和转录因子如STATs的相关通路共表达网络,我们的研究结果将帮助我们更好地在全基因组层面上了解β-catenin对于小鼠肾脏发育的调控作用。

关 键 词：Β-CATENIN 肾脏 发育不全 基因表达谱 调控机制  

分 类 号：Q344]