文献类型：期刊文章

作　　者：张体付[1] 戚维聪[1] 顾闽峰[2] 张晓林[1] 李坦[1] 赵涵[1]

机构地区：[1]江苏省农业科学院/江苏省农业生物学重点实验室,江苏南京210014 [2]盐城市新洋农业试验站,江苏盐城224336

出　　处：《作物学报》

基　　金：江苏省农业科技自主创新资金项目[CX(14)2044];美国国际发展署Securing Water for Food Award-salt Tolerant Quinoa子项目(UR4443 B)资助~~

年　　份：2016

卷　　号：42

期　　号：4

起止页码：492-500

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2014、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2015_2016、EBSCO、FSTA、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：藜麦因营养均衡受到越来越多的关注,但尚未深入开展其基础研究。开发微卫星序列重复SSR分子标记将为藜麦的遗传分析提供重要资源。本研究利用NCBI数据库中藜麦RNA测序RNA-Seq及表达序列标签EST数据挖掘、验证及评价藜麦EST-SSR,共发现1862个藜麦非单核苷酸EST-SSR。其中,二核苷酸重复最多(38.3%),六核苷酸重复最少(11.7%)。不同重复类型SSR的数量随着核苷酸数目的增加呈下降趋势。在随机选取验证的119个EST-SSR标记中,66(55.9%)个能够扩增出清晰条带,39个在4份藜麦资源中具有多态性,且其多态性与重复序列长度不具有显著相关性。t测验显示,多态性EST-SSR在藜麦与其他藜科种质间不存在显著差异,说明其具有良好的通用性,可用于藜科物种的遗传关系分析。

关 键 词：藜麦  EST-SSR 分子标记 遗传关系  通用性  

分 类 号：S519]