文献类型：期刊文章

作　　者：陈泽斌[1,2] 李冰[3] 王定康[4] 余磊[1] 徐胜光[1] 任禛[1] 靳松[1] 戴丽君[5]

机构地区：[1]昆明学院农学院,云南昆明650214 [2]云南省都市特色农业工程技术研究中心,云南昆明650214 [3]中国科学院昆明动物研究所,云南昆明650223 [4]昆明学院生命科学与技术系,云南昆明650214 [5]彭阳县科技服务中心,宁夏固原756500

出　　处：《现代食品科技》

基　　金：国家自然科学基金项目(41361056);云南省教育厅科学研究项目(2014Y390);云南省高校优势特色重点学科(生态学)建设项目共同资助

年　　份：2016

卷　　号：32

期　　号：2

起止页码：113-120

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2014、CAB、CAS、CSA-PROQEUST、EI、FSTA、IC、PROQUEST、RCCSE、SCOPUS、UPD、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：为了调查玉米内生细菌种类多样性。应用高通量测序技术测定玉米内生细菌的16S rDNA-V4变异区序列,应用Qiime和Mothur等软件整理和统计样品序列数目和操作分类单元(OTUs)数量,分析物种的丰度、分布和Alpha多样性,以及物种丰富度的差异。本研究获得用于分析的有效序列和OTU数为96334/156;稀疏曲线表明测序深度充分,OTU的数量接近于饱和。玉米(样品名YM)的Chao1指数为156.0,Shanno多样性指数为1.211。玉米内生细菌分布于以下6个属:鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas,37.78%)、盐单胞菌属(Halomonas,33.33%)、假单胞菌属(Pseudomonas,13.33%)、希瓦氏菌属(Shewanella,6.67%)、甲基杆菌属(Methylobacterium,4.44%)、土地杆菌属(Pedobacter,4.44%);玉米内生细菌优势菌属为鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas,37.78%)、盐单胞菌属(Halomonas,33.33%)。Illumina Mi Seq高通量测序技术为植物内生细菌的研究提供了更加准确、科学的数据资源。

关 键 词：高通量测序 玉米 内生细菌 多样性

分 类 号：TS207.4]