期刊文章详细信息
基于颜色判定的RT-LAMP技术检测HCoV-NL63冠状病毒基因
Visual Detection of Human Coronavirus NL63 by Reverse Transcription LoopMediated Isothermal Amplification
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]无锡出入境检验检疫局中国检验检疫科学研究院(无锡)人体携带病原体研究室,无锡214101 [2]中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所病毒病应急技术中心,北京102206 [3]南京医科大学基础医学院江苏省现代病原生物学重点实验室,南京210029
基 金:传染病重大专项(2014ZX10004001-002;2013ZX10004001)
年 份:2016
卷 号:32
期 号:1
起止页码:56-61
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2014、BIOSISPREVIEWS、CAB、CAS、CSCD、CSCD2015_2016、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:建立了一种适合于国境口岸简便、快速、灵敏和特异检测人冠状病毒NL63(HCoV-NL63)的核酸检测方法。通过建立基于颜色判定的逆转录环介导等温扩增(Reverse transcription loop-mediated isothermal amplification,RT-LAMP)技术,针对HCoV-NL63核衣壳蛋白(Nucleocapsid,N)基因序列设计出6条特异性引物,在等温条件下(63℃)进行扩增反应60min,在扩增前加入钙黄绿素作为反应指示剂,并结合浊度仪进行实时监测,以最终反应颜色变化作为结果判断标准。利用该方法对同种属其他人冠状病毒、诺如病毒、流感病毒进行检测,以分析该方法的诊断特异性。应用该方法对梯度稀释的HCoV-NL63病毒RNA进行检测,以分析该方法的诊断灵敏性,并与常规real-time RT-PCR方法进行比较。结果显示,本研究建立的基于颜色判定的RT-LAMP方法在短时间内(40min)即可达到对HCoV-NL63的快速检测。该检测方法与加入其它病毒RNA模板溶液颜色均不产生改变,具有较高的检测特异性。检测灵敏性最低检测下限为1 600拷贝/反应。本研究建立的基于颜色判定的RT-LAMP方法可实现对HCoV-NL63冠状病毒现场快速检测,具有在国境口岸以及基层医疗机构和疫区现场推广应用的潜力。
关 键 词:HCOV-NL63 RT-LAMP 快速检测
分 类 号:R373.9]
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