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期刊文章详细信息

miR-199a-3p靶基因预测及生物信息学分析    

Prediction of miR-199a-3p targets gene and its bioinformatics analysis

  

文献类型:期刊文章

作  者:谢小娟[1,2] 潘晶晶[2] 魏力强[1] 陈葳[2]

机构地区:[1]陕西省临床检验中心,陕西西安710068 [2]西安交通大学第一附属医院检验科,陕西西安710061

出  处:《西安交通大学学报(医学版)》

年  份:2016

卷  号:37

期  号:2

起止页码:244-249

语  种:中文

收录情况:AJ、BDHX、BDHX2014、CAS、CSCD、CSCD_E2015_2016、EMBASE、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊

摘  要:目的为深入研究miR-199a-3p在膀胱癌形成和发展中的作用提供理论依据。方法分析miR-199a-3p序列,预测其靶基因和转录因子,并对靶基因进行GO富集和KEGG Pathway分析;构建TF-miR-199a-3p-靶基因网络调控图。结果 miR-199a-3p序列在多物种间具有高度保守性;GO分析发现miR-199a-3p的靶基因参与细胞调节、代谢调节、细胞大分子生物合成等生物过程(P<0.01);KEGG Pathway分析发现miR-199a-3p的靶基因显著富集在上皮细胞的细菌入侵通路、ECM受体的相互作用通路、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、小细胞肺癌通路、癌症中的蛋白聚糖通路等;根据构建的TF-miR-199a-3p-靶基因网络调控图,挖掘出可能受miR-199a-3p调控的重要基因有MYC、SP1、mTOR、NFκB、NFκB1等。结论 miR-199a-3p可能通过直接靶向作用mTOR,调节PI3K-Akt-mTOR信号通路,从而参与膀胱癌的形成和发展。

关 键 词:miR-199a-3p  生物信息学 MTOR GO富集分析  KEGG  Pathway分析  膀胱癌  PI3K-AKT MAPK 蛋白聚糖

分 类 号:Q74] R737.14]

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