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进境草种种带真菌的检测与初步鉴定
Detection and identification of seed-borne fungi isolated from imported grass seeds
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]草地农业生态系统国家重点实验室兰州大学草地农业科技学院,甘肃兰州730020 [2]中国农业大学农学与生物技术学院,北京100193 [3]北京出入境检验检疫局检验检疫技术中心,北京101312
基 金:国家质量监督检验检疫总局科技计划项目--进境牧草种子真菌筛查技术研究初探(2015IK225);国家质量监督检验检疫总局科技计划项目"进境种子携带植物病原细菌筛查技术初探"(2014IK005);国家质量监督检验检疫总局公益性课题--应用Si RNA测序技术筛查重要检疫性植物病毒方法研究(201310068);进境牧草种子有害生物风险评估(2015BK024)
年 份:2016
卷 号:33
期 号:1
起止页码:46-53
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2014、CAB、CAS、CSCD、CSCD2015_2016、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:采用平皿测定法对我国北京口岸2014年进境草种高羊茅(Festuca arundinacea)、多年生黑麦草(Lolium perenne)和苏丹草(Sorghum sudanense)携带真菌进行分离培养,利用ITS4和ITS5引物对其内转录间隔区(Internal Transcribed Spacer,ITS)进行扩增,PCR产物纯化后测序并与数据库中的已知序列进行BLAST比对,对种带真菌进行初步鉴定。研究结果表明,不同来源种子携带真菌种类差异较大,从5个国家的7个进境草种批次中共检测出13属21种48株真菌,主要菌群为镰刀菌属(Fusarium spp.)、曲霉属(Aspergillus spp.)、茎点霉属(Phoma spp.)和链格孢属(Alternaria spp.)。基于ITS序列构建系统发育树,能够将所有分离到的真菌鉴定到属,但是在种水平上鉴定有限,不能将细极链格孢(Alternaria tenuissima)、细交链孢(A.alternata)和乔木链格孢(A.arborescens)很好地区分开。本研究明确了5个来样量较大国家的草种带菌情况,ITS基因能够运用于口岸草种携带真菌的初步检测鉴定。
关 键 词:进境草种 种带真菌 ITS 鉴定
分 类 号:S41-30]
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