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棉花bZIP转录因子基因GhbZIP15的克隆与表达分析
Molecular Cloning and Expression of a b ZIP Transcription Factor Gene Ghb ZIP15 in Cotton(Gossypium hirsutum L.)
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]新疆农业大学农学院/农业生物技术重点实验室,新疆乌鲁木齐830052
基 金:新疆农业大学校前期课题资助(XJAU201311)
年 份:2015
卷 号:27
期 号:6
起止页码:515-523
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2014、CAB、CSCD、CSCD2015_2016、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:b ZIP转录因子在植物抵御各种逆境胁迫中有重要作用。本研究依据生物信息学分析,采用RT-PCR(Reverse transcription polymerase chain reaction)方法从棉花中克隆了一个b ZIP转录因子基因,命名为Ghb ZIP15(Gen Bank登录号为KP938299)。该基因c DNA全长1980 bp,其开放阅读框为966 bp,编码321个氨基酸的蛋白,预测分子量为37.1 k D,等电点为7.44。SMART蛋白结构预测发现,该蛋白含有b ZIP家族典型的BRLZ碱性结构域和亮氨酸拉链,属于B-zip1家族。系统进化树分析表明Ghb ZIP15属于b ZIP转录因子AREB亚家族,和拟南芥A亚家族的Atb ZIP12,At ABF1和At ABF2亲缘关系最近。洋葱表皮细胞中瞬时表达分析表明,Ghb ZIP15主要定位于细胞核中。RT-PCR分析表明Ghb ZIP15对干旱、高盐、低温等处理都有一定程度的响应,推测该基因对棉花非生物胁迫的调控起重要作用。
关 键 词:棉花 b ZIP转录因子 非生物胁迫 GHB ZIP15 克隆表达
分 类 号:S562]
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