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期刊文章详细信息

元基因组学方法在环境微生物中的研究进展    

Progress in the Study of Environmental Microbes by Metagenomic Methods

  

文献类型:期刊文章

作  者:刘捷孟[1,2] 戚继[1]

机构地区:[1]复旦大学生命科学学院遗传与发育协同创新中心植物科学研究所,上海200433 [2]复旦大学理论生命科学研究中心物理系,上海200433

出  处:《生物技术通报》

年  份:2015

卷  号:31

期  号:11

起止页码:51-59

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2014、CAS、CSCD、CSCD_E2015_2016、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘  要:新一代测序技术的快速发展,使得元基因组学研究方法成为了理解环境微生物群落结构和相互作用的重要手段之一。元基因组学方法不需要将环境样本中的微生物单独分离培养,而是作为整体进行研究,因而可以回避传统研究时分离培养微生物的困难。基于这一优势,人体、海洋和土壤等环境有关的各项环境微生物测序计划相继启动,并取得了一系列重要的研究进展。探讨了元基因组测序数据分析中所经常采用的方法,以及有关流程的优势和局限性,并进一步讨论了这些方法在各种环境微生物研究中的应用和成果。

关 键 词:元基因组  高通量测序 生物信息 环境微生物

分 类 号:X172] Q78]

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