文献类型：期刊文章

作　　者：段新丽[1] 张欣[1] 雷鸣[1]

机构地区：[1]化工资源有效利用国家重点实验室,北京化工大学理学院,现代药物研究所,北京100029

出　　处：《高等学校化学学报》

基　　金：国家自然科学基金(批准号:21203006,21373023)资助~~

年　　份：2015

卷　　号：36

期　　号：12

起止页码：2491-2496

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2014、CAS、CSCD、CSCD2015_2016、EI(收录号：20160301807707)、IC、JST、RCCSE、RSC、SCI-EXPANDED(收录号：WOS:000369592900020)、SCIE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：采用QM(PM3)/MM分子动力学(MD)方法模拟了烟酰胺酶催化烟酰胺水解脱氨形成烟碱酸的反应过程.计算结果表明,硫的亲核进攻是整个反应的速率控制步骤.当改变Ala155所在Loop区的位置,在亲核进攻时,底物能够自由旋转,可以加速亲核进攻过程并降低整个催化反应的能垒.讨论了氨分子的离去过程和质子传递过程的相关细节.为烟酰胺酶的定点突变以及脱氨酶的设计提供了有益的参考.

关 键 词：烟酰胺酶  脱氨 反应机理 QM/MM方法  分子动力学模拟

分 类 号：O641]