文献类型：期刊文章

作　　者：李路茜[1,2] 张媛媛[2] 刘海灿[2] 谭晓罗[2,3] 李振军[2] 楼永良[1]

机构地区：[1]温州医科大学检验医学院检验医学教育部重点实验室,温州325035 [2]传染病预防控制国家重点实验室中国疾病预防控制中心传染病预防控制所,北京102206 [3]南华大学,衡阳421001

出　　处：《中国人兽共患病学报》

基　　金：863课题(No.2014AA021404);国家科技重大专项(No.2013ZX10004221);公益性卫生行业专项(No.201302006)联合资助~~

年　　份：2015

卷　　号：31

期　　号：11

起止页码：1017-1022

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2014、CAB、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2015_2016、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘　　要：目的 评价16SrDNA序列在诺卡菌菌种鉴定中的应用价值。方法 对13种49株诺卡菌（43株标准株和6株临床株）16SrDNA序列片段进行PCR扩增,将扩增片段进行纯化后测序,从GenBank上下载32株诺卡菌（包括星形诺卡菌,少食诺卡菌,短链诺卡菌等）及3株棒状杆菌（Corynebacterium,C.）,3株弗兰克氏菌属（Frankia,F.）,3株分支杆菌（Mycobacterium,M.）,3株链霉菌（Streptomyces,S.）的16SrDNA序列。对所测得的诺卡菌序列及GenBank所报道的诺卡菌序列用DNASTAR程序分析处理,计算种内及种间相似性,用Mega6.06构建诺卡菌菌种系统进化树。结果 在81条受试诺卡菌16SrDNA序列中,16SrDNA能将诺卡菌大致可分为11群,除了不能将亚种分离外,诺卡菌其他种属均能得到很好的分离。诺卡菌16SrDNA种内及亚种内相似性为99.1%~100%;种间相似性在95.7%~98.8%之间。结论 16SrDNA序列分析是一种快速,简单,特异性较好的诺卡菌菌种鉴定方法,能将诺卡菌鉴定至种的水平。

关 键 词：诺卡菌 16S  RDNA序列 鉴定  

分 类 号：R378]