文献类型：期刊文章

作　　者：齐燕姣[1] 陆会宁[2] 金能智[3] 赵娅敏[1]

机构地区：[1]西北民族大学榆中校区化工学院,兰州730124 [2]西北民族大学榆中校区生命科学与工程学院,兰州730124 [3]甘肃省计算中心,兰州730000

出　　处：《生物信息学》

基　　金：国家民委科研项目(14XBZ021);中央高校基本科研业务费专项资金项目(NO.31920130035);中央高校基本科研业务费专项资金项目(zyz2011064)

年　　份：2015

卷　　号：13

期　　号：3

起止页码：141-149

语　　种：中文

收录情况：ZGKJHX、普通刊

摘　　要：用生物信息学的方法分析不同物种的α-葡糖糖苷酶的亲缘关系,分析降血糖药物米格列醇与甜菜(Beta vulgaris)的α-葡糖糖苷酶相互作用位点在其他亲缘关系较近的物种中相应的氨基酸变化特点,结果表明米格列醇位于一个凹向酶分子内部的狭窄的结合口袋中,其间的相互作用主要以静电相互作用、氢键和范德华力为主。由于米格列醇的强水溶性和多羟基的特点,与酸性的天冬氨酸之间形成多个Ο-Η氢键,对甜菜(Beta vulgaris)的α-葡萄糖苷酶具有较好的抑制作用。通过TMHMM预测甜菜(Beta vulgaris)的α-葡萄糖苷酶的序列,结果未发现跨膜区。通过多序列比对发现,在米格列醇与甜菜(Beta vulgaris)的α-葡萄糖苷酶相互作用位点处的氨基酸中,在与其亲缘关系较近的5个物种茶(Camellia sinensis),黄瓜(Cucumis sativus),木本棉(Gossypium arboretum),甘庶属割手密(Spontaneum)和蒺藜状苜蓿(Medicago truncatula)中有81.82%的氨基酸都是保守的,且主要是极性的氨基酸,如色氨酸和天冬氨酸。这为进一步研究降血糖药物在其他物种中的表现及相互作用提供了重要的科学依据。

关 键 词：Α-葡萄糖苷酶 相互作用 序列比对  系统发育关系

分 类 号：TP925.4[自动化类]