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大豆胞囊线虫主效抗病基因Rhg4(GmSHMT)的CAPS/dCAPS标记开发和利用
Development and Utilization of CAPS/dCAPS Markers Based on the SNPs Lying in Soybean Cyst Nematode Resistant Genes Rhg4
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]农作物基因资源与基因改良国家重大科学工程/农业部北京大豆生物学重点实验室/中国农业科学院作物科学研究所,北京100081 [2]黑龙江省农业科学院大豆研究所,黑龙江哈尔滨150086
基 金:国家自然科学基金项目(31171575);中国农业科学院科技创新工程(作物分子标记技术及其应用)项目资助
年 份:2015
卷 号:41
期 号:10
起止页码:1463-1471
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2014、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2015_2016、EBSCO、FSTA、IC、JST、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:大豆胞囊线虫(soybean cyst nematode,SCN)严重危害世界大豆生产,Rhg4(resistance to Heterodera glycines 4)是控制大豆SCN抗性的2个主效位点之一。本研究针对Rhg4(Gm SHMT)上的2个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)位点开发了快速、经济、简便易行的CAPS(Rhg4-389)和d CAPS标记(Rhg4-1165),并用开发的2个标记鉴定了以大豆胞囊线虫应用核心种质为主的193份代表性抗感种质。结果表明,Rhg4-389和Rhg4-1165位点间存在显著连锁不平衡(P=0.0001,r2=0.87),可形成4种单倍型。Rhg4-389-G/Rhg4-1165-T和Rhg4-389-C/Rhg4-1165-A为优势单倍型,稀有单倍型Rhg4-389-G/Rhg4-1165-A和Rhg4-389-C/Rhg4-1165-T是在中国抗源中新发现的单倍型。结合193份种质对SCN 3号小种抗性鉴定分析发现,Rhg4-389-G和Rhg4-1165-T主要存在于抗病种质,它们形成的单倍型对抗病种质鉴定效率可达94.1%。本研究开发了可用于辅助大豆SCN抗性鉴定且方便育种家利用的CAPS/d CAPS标记,且用其摸清了应用核心种质等重要抗源在Rhg4位点的"本底",为育种家有效利用这些优异抗源提供了重要信息。
关 键 词:大豆胞囊线虫 Rhg4 CAPS/dCAPS标记 单倍型 分子标记辅助选择 Rhg4
分 类 号:S435.651]
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