文献类型：期刊文章

作　　者：涂飞云[1] 刘晓华[1] 杜联明[2] 严超超[2] 黄晓凤[1]

机构地区：[1]江西省林业科学院,江西南昌330013 [2]四川大学生命科学学院/四川省濒危野生动物保护生物学重点实验室,四川成都610064

出　　处：《江西农业大学学报》

基　　金：江西省科技计划项目(20123BBF60183);江西省科技成果重点转移转化计划(20142BBI90043);江西省林业科学研究院博士基金启动项目(2013521601);江西省科研院所基础设施配套项目(20151BBA13037)

年　　份：2015

卷　　号：37

期　　号：4

起止页码：708-711

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2014、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD_E2015_2016、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘　　要：大鼠（Rattus norvegicus）一直是医学和药学研究中良好的模式生物,其全基因组是继人和小鼠之后第3个被测定的哺乳动物。利用生物信息学软件对大鼠全基因组1~6 bp不同类型重复微卫星进行搜索及统计,表明大鼠全基因组微卫星序列共1 483 525个,其序列长度占全基因组的1.41%。大鼠全基因组微卫星分布频率以12号染色体最高,其次是10号染色体,最低的是X性染色体。大鼠微卫星数量与染色体DNA序列长度具有相关性（r=0.978,P〈0.000 1）,微卫星分布具有随机性。大鼠全基因组不同重复类型微卫星表现为二碱基（46.9%）〉单碱基（22.6%）〉四碱基（17.7%）〉三碱基（8.4%）〉五碱基（2.4%）〉六碱基（2.0%）,单碱基、二碱基、三碱基、四碱基、五碱基、六碱基优势微卫星类型分别是A、AC、AGG、AAAC、AAACA、ACAGAG。本研究为大鼠全基因组微卫星筛选及进一步的研究提供数据支持。

关 键 词：大鼠  基因组 微卫星序列

分 类 号：S865.12]