文献类型：期刊文章

作　　者：洪璇[1,2] 洪有为[3] 陈仲巍[2] 赵春贵[1] 杨素萍[1]

机构地区：[1]华侨大学生物工程与技术系,福建厦门361021 [2]厦门医学高等专科学校药学系,福建厦门361008 [3]中国科学院城市环境研究所,福建厦门361021

出　　处：《微生物学通报》

基　　金：国家海洋公益性行业科研专项项目(No.201505026);中国科学院城市环境与健康重点实验室基金项目(No.KLUEH201005);福建省教育厅科技项目(No.JB11275)

年　　份：2015

卷　　号：42

期　　号：9

起止页码：1639-1650

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2014、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2015_2016、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：【目的】结合16S rRNA基因克隆文库和nirS基因克隆文库的分析,揭示九龙江河口区nirS型反硝化细菌多样性。【方法】选取九龙江河口区一富营养化采样点,分别采集水样及沉积物样品,进行理化因子的测定并提取细菌总DNA。以水样DNA构建16S rRNA基因克隆文库,以沉积物DNA构建nirS基因克隆文库,分析微生物群落结构的多样性并构建系统发育树。【结果】从16S rRNA基因克隆文库中获得86条有效序列,按97%的序列相似性划分为53个OTU,分别属于Proteobacteria门、Planctomycetes门、Bacteroidetes门、Actinobacteria门、Firmicutes门和Chloroflexi门。其中属于Proteobacteria门OTU的克隆子占克隆数的62.9%,是最优势的类群,分属于Alphaproteobacteria、Betaproteobacteria、Gammaproteobacteria和Deltaproteobacteria纲等。从nirS基因克隆文库中获得190条有效序列,翻译为氨基酸序列后,按82%的序列相似性划分为60个OTU,并定位到属的水平。其中Proteobacteria门是最优势的类群,占文库克隆子总数的71.6%,包括Alphaproteobacteria纲(5.8%)、Betaproteobacteria纲(49.0%)和Gammaproteobacteria纲(16.9%)。nirS基因克隆文库中丰度最高的OTU与Gen Bank中的一株可培养反硝化菌Thauera sp.R-26906具有100%的序列相似性。【结论】九龙江河口区的微生物以及亚硝酸盐还原酶基因(nirS)具有丰富的多样性。大部分Nir S序列在Gen Bank中的最相似序列来源于河口、海湾等相似的环境。

关 键 词：反硝化细菌 NIR S基因 微生物多样性 河口区  系统发育分析

分 类 号：Q93]