文献类型：期刊文章

作　　者：邵世滨[1,2] 闵自信[1] 郭源旭[1] 王权成[1] 孙梦瑶[1] 韩燕[1] 孙健[1]

机构地区：[1]西安交通大学医学部生物化学与分子生物学系,陕西西安710061 [2]山东医学高等专科学校生物化学教研室,山东临沂276002

出　　处：《西安交通大学学报（医学版）》

基　　金：国家自然科学基金资助项目(No.81371986);中国博士后基金(No.2014T70928;No.2013M530427);中央高校基本科研业务费专项交叉面上专项(No.xjj2015073)~~

年　　份：2015

卷　　号：36

期　　号：4

起止页码：462-466

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2014、CAS、CSCD、CSCD_E2015_2016、EMBASE、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的：分析大鼠软骨形成过程中小分子 RNA（sRNA）表达谱变化及其基因功能,探讨软骨细胞增殖与分化的机制。方法取新生、断乳、性成熟3个时间节点的雌性 SD 大鼠股骨头软骨构建 sRNA 文库,Solexa 测序平台鉴定软骨组织全部 sRNA 序列表达,所得的全部清洁序列与 SD 大鼠基因组信息比对,并做生物信息学分析。结果3个文库筛选出与基因组序列完全匹配序列,分别对应着217921条（41.23%）、196650条（38.74%）、245436条（41.54%）unique sRNA 序列。长度为20~24 nt 的 sRNA 占比：d 0为71.94%、d 21为72.85%、d 42为86.39%；其中,长度为22 nt的 sRNA 约占清洁序列的一半。文库序列分布特征,符合高质量 sRNA 文库的特征。超过总数62%的清洁序列来自于成熟 miRNA 序列,但在3个文库中的占比却仅仅只有0.69%、0.78%和0.63%。约60%的unique sRNA 序列无法与 miRBase 20.0和 Rfam9.1匹配。结论3个 sRNA 文库的 miRNA 这种分布模式,可能暗示着有功能不同或者来源各异的 miRNA,参与了对骨骼发育和骨形成关键阶段软骨细胞增殖与分化的调控。

关 键 词：SRNA 生物信息学 软骨生成  大鼠  Solexa测序  

分 类 号：Q78]