文献类型：期刊文章

作　　者：袁方[1] 廖泽容[2] 张璐[3] 陈元晓[3]

机构地区：[1]昆明医科大学基础医学院生物化学与分子生物学系,云南昆明650500 [2]昆明医科大学现代教育技术中心 [3]昆明医科大学基础医学院细胞生物学与遗传学系

出　　处：《中国病原生物学杂志》

年　　份：2015

卷　　号：10

期　　号：5

起止页码：406-409

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2014、CAB、CSCD、CSCD_E2015_2016、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的应用生物信息学分析软件预测结核分枝杆菌脂酰辅酶A合成酶(FadD3)氨基酸序列的结构与功能。方法应用生物信息学在线工具NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)、Expasy(http://ca.expasy.org/)、SWISSMODEL(http://swissmodel.expasy.org/)、客户端软件clustalx等进行多重序列比较、同源性分析、同源模建及蛋白功能活性位点分析;应用ProtParam软件(http://web.expasy.org/protparam)预测FadD3基因编码FadD3的蛋白理化性质;采用最小值进化法(the Minimum Evolution method)构建分子进化树。结果 FadD3(Mt-FACS)与其他物种的脂酰辅酶A合成酶(FACS)含相同的保守序列及催化活性位点,第174-185氨基酸残基是AMP结合部位,也是FadD3的保守区域;第422-497氨基酸残基是FACS与底物(脂酸)结合的部位,亦是结核分枝杆菌脂酰辅酶A合成酶的C末端。分子进化分析表明结核分枝杆菌脂酰辅酶A合成酶(Mt-FACS)与睾丸酮丛毛单胞菌脂酰辅酶A合成酶(CtFACS)的进化关系较近,与黑腹果蝇脂酰辅酶A合成酶(Dm-FACS)的进化关系较远。结论生物信息学预测提示FadD3是结核分枝杆菌脂类代谢及耐药性研究的潜在靶蛋白。

关 键 词：结核分枝杆菌 脂酰辅酶A合成酶  结构  功能  生物信息学

分 类 号：R378.911]