文献类型：期刊文章

作　　者：陈秀[1,2] 张晓君[3] 李沁元[1] 薛正晟[3] 李桂鼎[1] 贾鳗[1] 赵立平[3] 姜怡[1]

机构地区：[1]云南大学云南省微生物研究所,云南昆明650091 [2]东北大学生命科学与健康学院,辽宁沈阳110819 [3]上海交通大学生命科学技术学院生物科学与技术系,上海200240

出　　处：《微生物学报》

基　　金：国家自然科学基金(31270001,31460005)~~

年　　份：2015

卷　　号：55

期　　号：6

起止页码：683-690

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2014、BIOSISPREVIEWS、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2015_2016、IC、JST、PUBMED、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：【目的】分析比较几种哺乳动物粪便细菌群落多样性,了解粪便细菌多样性与动物进化和食物的关系。【方法】采集6种哺乳动物粪便样品;提取总DNA;PCR扩增,获得16S rDNA V3标签片段;用454焦磷酸测序技术进行高通量测序;主要基于QIIME平台分析比较粪便细菌多样性。【结果】分析发现,厚壁菌门和拟杆菌门广泛存在于各样品中,并且占绝对优势。α多样性分析发现,杂食性的长臂猿、黑猩猩和川金丝猴的多样性最高,其次是肉食性的东北虎,来自熊科杂食性的亚洲黑熊和大熊猫的多样性最低。β多样性分析发现,白眉长臂猿、黑猩猩、川金丝猴几种灵长目动物粪便的菌群相似,而大熊猫菌、黑熊、孟加拉虎几种食肉目动物粪便细菌群相似但食肉动物孟加拉虎主要又因含梭杆菌门而区别于其他动物。【结论】动物粪便细菌优势类群明显;同种动物重复样本的相似性最高,各种动物多样性存在差异,但几种灵长类动物粪便细菌多样性更丰富;动物粪便细菌的组成和动物的进化及食物相关。本研究为哺乳动物粪便菌资源及后续研究提供了借鉴。

关 键 词：哺乳动物 粪便细菌 454高通量测序  16S rDNA  多样性

分 类 号：Q93]