期刊文章详细信息
16SrRNA高通量测序研究有龋者唾液微生物群落结构及多样性
Study of Caries Microbial Community Structure and Diversity by 16S rRNA High-throughput Sequencing
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]兰州大学口腔医学院修复科,甘肃兰州730000 [2]西北民族大学口腔医学院
基 金:国家自然科学基金地区项目(编号:31160124/C0309;31360124/C0309);甘肃省科技计划项目(编号:1204FKCA168;1308RJZA248)
年 份:2015
卷 号:31
期 号:5
起止页码:461-465
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2014、CAS、CSCD、CSCD_E2015_2016、IC、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:目的:通过16SrRNA高通量测序研究有龋和无龋者唾液的微生物群落结构及其差异。方法:在甘肃省康乐县景古镇居民口腔检查中随机选取14位汉族居民,其中,7例有龋(caries-active,CA组,DMFT≥4)、7例无龋(caries-free,CF组)。采取唾液样本,提DNA,PCR扩增,利用Illumina Miseq测序平台对16SrRNA V4区进行双端测序;利用Mothur、MEGAN4、Cluster 3.0和Java Treeview等软件进行细菌群落结构及多样性的差异分析。结果:共得到118151条优质序列,发现5738个OTUs,2795个物种,归属27个门,218个属。CA组和CF组唾液微生物群落结构有差异,其中,门水平上,Firmicutes和SR1在CA组显著低于CF组(P<0.05)。属水平上,Rothia、Alistipes和Catonella在CA组显著低于CF组(P<0.05),Scardovia在CA组显著高于CF组(P<0.05);CA组和CF组OTUs分别为(550.2±26.48),(597.4±66.07),CA组和CF组Simpson多样性指数分别为(0.73±0.03),(0.49±0.01),均无统计学差异。结论:人类口腔唾液有复杂的微生物群落结构;在门水平和属水平上,有龋者的微生物种类较无龋者稍有减少;Firmicutes和SR1菌门,Rothia、Alistipes和Catonella菌属的存在与龋病呈负相关;相反地,Scardovia等菌属的存在与龋病呈正相关。
关 键 词:龋病 微生物群落结构 16SrRNA高通量测序 唾液
分 类 号:R781.1[口腔医学类]
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