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期刊文章详细信息

4种DNA条形码在黄毛鼠种类鉴定中的比较    

Comparison of four DNA barcoding in Rattus losea identification

  

文献类型:期刊文章

作  者:胡群[1] 马思杰[1] 裘炯良[2]

机构地区:[1]大榭出入境检验检疫局鼠传疾病检测实验室,浙江宁波315812 [2]宁波出入境检验检疫局

出  处:《中国媒介生物学及控制杂志》

基  金:宁波市自然科学基金(2013A610240)~~

年  份:2015

卷  号:26

期  号:3

起止页码:286-289

语  种:中文

收录情况:AJ、CAB、CAS、CSCD、CSCD_E2015_2016、IC、JST、WOS、ZGKJHX、ZR、普通刊

摘  要:目的比较COⅠ、Cytb、16S rRNA、D-loop四个DNA条形码对黄毛鼠鼠种的鉴定效果。方法将大榭港区捕获的1只黄毛鼠样本HX41,提取基因组DNA,使用特异性引物对线粒体COⅠ、Cytb、16S rRNA、D-loop基因进行扩增并对扩增产物进行测序。将测序结果与GenBank中的相似鼠种DNA构建分子进化树进行同源性分析。结果以COⅠ、Cytb、D-loop基因所构建分子进化树中,黄毛鼠均能独立形成分支,且HX41均处于黄毛鼠分支上。HX41的COⅠ基因序列与黄毛鼠HN158株遗传距离最为接近,值为0.0034;Cytb基因序列与黄胸鼠HN99株遗传距离最为接近,值为0.0355,但HN99鼠种数据存在错误;D-loop基因序列与黄毛鼠HN105株遗传距离最为接近,值为0.0439。由于现有GenBank中缺少黄毛鼠16SrRNA基因序列,无法构建进化树。结论对鼠种进行分子鉴定时,有必要根据GenBank数据库的完整性和准确性选择合适的DNA条形码。

关 键 词:黄毛鼠 种类鉴定  DNA条形码

分 类 号:S443]

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同被引文献:

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