期刊文章详细信息
玉米弯孢叶斑病菌RhoGAP基因家族的全基因组鉴定与生物信息学分析
Genome-wide Identification and Analysis of RhoGAP Family from Curvularia lunata
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]黑龙江八一农垦大学农学院植物病理与应用微生物研究所,黑龙江大庆163319
基 金:国家自然基金项目(31101407;31272026;31301611);2013年黑龙江省研究生学术交流项目(黑教研[2013]145号)
年 份:2015
卷 号:23
期 号:3
起止页码:44-49
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2014、CAB、CAS、CSCD、CSCD_E2015_2016、IC、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:RhoGAPs(GTPase activating proteins)通过与Rho GTP酶结合,促使GTP酶水解成Rho GDP无活状态,在生物体中调控着重要的生物学功能。在全基因组上对玉米弯孢叶斑病菌(C.lunata)中RhoGAP基因家族成员进行鉴定,对其序列特征分析。结果表明,玉米弯孢叶斑病菌(C.lunata)有5个RhoGAP基因家族成员,分布在5不同的Scaffold上,其基因结构分析显示,外显子和内含子大小与位置均不一样,表现出复杂的基因结构。序列比对和系统进化分析发现,5个RhoGAP氨基酸序列与其他真菌来源的RhoGAP一样具有特征性保守序列区,与粗糙脉胞菌(N.crassa)和小麦黄斑叶斑病菌(P.tritici-repentis)的RhoGAP蛋白关系密切,其亲缘关系最近。
关 键 词:玉米 RHOGAP 弯孢叶斑病菌 基因家族 基因结构
分 类 号:S513.035.3]
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