文献类型：期刊文章

作　　者：郭晓兰[1] 司露露[1] 管大伟[2] 王颖[1] 于玉凤[1] 方丹云[1,3] 武婕[2] 江丽芳[1,3]

机构地区：[1]中山大学热带病防治研究教育部重点实验室,广东广州510080 [2]广东省疾病预防控制中心,广东广州511430 [3]中山大学中山医学院微生物学教研室,广东广州510080

出　　处：《中山大学学报（医学科学版）》

基　　金：国家自然科学基金(81071367);广东省高等学校自然科学研究重点项目(GXZD0901)

年　　份：2015

卷　　号：36

期　　号：2

起止页码：167-175

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2014、CAS、CSA、CSCD、CSCD2015_2016、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：【目的】对两株从轻症病例和重症死亡病例中分离的人H7N9禽流感病毒进行全基因组测序,研究其来源、基因组特征以及相互间的分子差异,旨在了解毒株的遗传进化特征与其致病性及其所致疾病临床类型的关系,为进一步阐明H7N9禽流感病毒的致病机制提供科学依据。【方法】选取两株从轻症病例和重症死亡病例中分离的H7N9禽流感病毒进行全基因组序列测定;运用生物信息学软件比较分析两株病毒的遗传进化关系、基因组特征、受体结合位点、宿主特异性位点及致病相关位点等重要分子特征;从禽流感共享数据(GISAID)下载2013年至2014年10月轻症和重症病例的病毒分离株序列,分析致病相关关键位点差异,并分析这些变异与其致病性及所致疾病临床类型的关系。【结果】这两株H7N9禽流感病毒的HA、NA和M基因来源于2013年华东地区流行的H7N9禽流感病毒,NP、NS、PA、PB1和PB2基因来源于2013年在广东地区禽类中流行的H9N2禽流感病毒;H7N9禽流感病毒PA蛋白L336M和PB1蛋白I368V的突变率随流行时间的延长而逐渐上升,并存在地区差异;两株病毒各基因核苷酸同源性达到99.2%以上,氨基酸同源性在99.5%以上,但各基因节段存在个别氨基酸的差异,其中HA受体结合位点存在一个关键氨基酸的差异(226L和226 Q),宿主特异性位点存在两个关键氨基酸的差异(PB2-591L和PB2-591Q,PB2-627E和PB2-627K),毒力位点存在两个关键氨基酸差异(PA-353R和PA-353K,PB2-627E和PB2-627K);M2均发生了S31N突变;潜在糖基化位点均相对保守;2013年至2014年10月报道的重症病例病毒分离株PB2蛋白E627K突变率高于轻症病例分离株。【结论】两株来自不同临床类型的H7N9禽流感病毒是一种新的重组病毒,是由华东地区流行的人H7N9禽流感病毒和在广东地区禽类中流行的H9N2禽流感病毒基因重组而来;H7N9禽流感病毒的某些致病相关的关键氨基�

关 键 词：H7N9禽流感病毒  测序 进化特征 分子特征 致病性  临床类型  

分 类 号：R373.13]