期刊文章详细信息
杨树新品种的SSR指纹图谱构建和倍性检测 ( EI收录)
Fingerprints of SSR Markers and Ploidy Detection for New Populus Varieties
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]林木遗传育种国家重点实验室国家林业局林木培育重点实验室中国林业科学研究院林业研究所,北京100091 [2]南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室,南京210037
基 金:国家高技术研究发展计划(863计划)课题(2011AA100201);林木遗传育种国家重点实验室基本科研业务费专项资金(TGB20130092014)
年 份:2015
卷 号:51
期 号:2
起止页码:69-79
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2014、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2015_2016、EI、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:【目的】对24份杨树种质进行指纹图谱构建、系谱关系鉴定和遗传多样性分析,并进行倍性检测,为杨树新品种鉴定和知识产权保护提供科学的理论依据,同时为杨树的育种工作奠定坚实的基础。【方法】利用 TP-M13-SSR 技术对24份杨树种质进行指纹图谱构建和系谱关系鉴定。从杨树 SSR 数据库中选取200对 SSR 引物,利用遗传背景差异大的 4份杨树种质进行引物筛选,选出19对扩增条带清晰、具有多态性且重复性好的引物对24份杨树种质进行扩增,利用 GeXP 毛细管电泳对 PCR 荧光产物进行检测,采用非加权组平均法(UPGMA)进行聚类分析,利用流式细胞术(FCM)进行倍性检测。【结果】19对 SSR 引物共扩增出102条条带,多态性条带97条,占95.10%,每个位点的等位基因数为2~11个,平均每对引物为5.37个。19对 SSR 引物均未检测到中林2025杨、中红杨和全红杨的条带差异,这3份种质相对于其他21份种质有特异的共同指纹条带;3对高效引物 ORPM_103,ORPM_180和 GCPM_1255可以将剩余21份杨树种质完全区分开。SSR 标记构建的指纹图谱与其系谱关系基本一致。对24份种质进行聚类分析,相似系数在0.50~1.00之间。当相似系数为0.56时,可分为5大类:第1类包括50号杨、中怀1号、中怀2号、I-69、帝国杨、中林2025杨、中红杨和全红杨;第2类包括青杨、森海 1号和森海 2号;第3类包括36号杨、丹红杨、南杨、239、1-116、中成 1号、中成 2号、中成3号、中成4号和中豫1号;第4类包括北抗杨和创新杨;第5类只有中林46杨。SSR 检测发现中怀 1号、森海 1号、森海 2号、青杨和中林46杨扩增出3个不同等位基因位点,其余19份杨树种质只出现 1个或2个等位基因位点;FCM 检测结果证实这5份种质均为三倍体,与 SSR 检测结果一致。【结论】本研究对24份杨树种质进行指纹图谱构建
关 键 词:杨树 TP-M13-SSR 指纹图谱 系谱分析 倍性检测
分 类 号:S718.46[林学类] S718.49
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