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仙居县80株结核分枝杆菌临床分离株VNTR基因分型研究
Analysis of the VNTR genotyping of 80 Mycobacterium tuberculosis clinical strains isolated from Xianju
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]仙居县疾病预防控制中心,浙江仙居317300
年 份:2015
卷 号:25
期 号:6
起止页码:866-869
语 种:中文
收录情况:CAS、ZGKJHX、普通刊
摘 要:目的了解仙居县结核分枝杆菌临床分离株不同基因型的分布情况,探讨该县结核病分子流行病学特征。方法收集2011年4月-2012年3月仙居县分离的80株结核分枝杆菌,采用15位点VNTR方法进行基因分型,用Bio Numerics 5.0软件对结果进行聚类分析。结果 15个VNTR位点中,MIRU26和Mtub21(HGI=0.827)多态性较高,ETRC(HGI=0.165)和ETRB(HGI=0.292)多态性较差;15位点VNTR分型方法的HGI指数为0.998。经Bio Numberics5.0软件聚类分析,可将检测到的78个基因型分为8个基因群(Ⅰ群-Ⅷ群),各群所含基因型分别为Ⅰ群7个,占8.97%;Ⅱ群8个,占10.26%;Ⅲ群43个,占55.13%;Ⅳ群5个,占6.41%;Ⅴ群2个,占2.56%;Ⅵ群7个,占8.97%;Ⅶ群4个,占5.13%;Ⅷ群2个,占2.56%。结论仙居县流行的结核分枝杆菌VNTR基因存在明显多态性,至少有8个VNTR基因群,主要流行群为Ⅲ群。
关 键 词:结核分枝杆菌 基因分型 数目可变串联重复序列 聚类分析
分 类 号:R378.911]
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